Fauna Bio utilise AWS pour harmoniser de grands jeux de données multiomiques et découvrir des gènes en rapport avec la santé humaine

Il peut être difficile pour les chercheurs d'harmoniser des jeux de données multiomiques à grande échelle pour identifier des gènes spécifiques importants pour le développement de traitements ciblés contre les maladies humaines.

Les animaux en hibernation luttent efficacement contre des changements physiologiques extrêmes semblables aux maladies humaines. Par exemple, ils peuvent subir l'équivalent de 25 crises cardiaques par an, mais sont capables de protéger et de réparer leurs tissus. L'activité de Fauna Bio est de découvrir des gènes pertinents pour la santé humaine en identifiant les gènes qui sont responsables de la lutte contre les maladies chez les animaux. À cette fin, Fauna bio superpose des analyses transcriptomiques, épigénomiques et du taux d'évolution pour découvrir des gènes susceptibles d’être des cibles médicamenteuses efficaces chez l'homme.

Fauna Bio a accumulé une vaste base de données pour stocker et traiter les données nécessaires à ces analyses. « Nous sommes ravis d'effectuer ces analyses et de stocker nos données dans le cloud AWS, car cela nous permet d'accéder efficacement à nos nombreux téraoctets de données à partir de plusieurs emplacements, » explique Linda Goodman, directrice technique chez Fauna Bio. Pour rendre cet énorme jeu de données accessible à ses propres chercheurs et collaborateurs, Fauna Bio a créé une plateforme hébergée sur Amazon Web Services (AWS). Cette plateforme permet aux utilisateurs de puiser dans des données génomiques, transcriptomiques et épigénomiques comparatives, de sélectionner les tissus affectés qui les intéressent, de concevoir le type de thérapie à éventuellement développer, puis d'afficher une carte visuelle des réseaux de gènes résultants, lesquels peuvent être analysés et potentiellement approfondis en vue de tests et de développements ultérieurs.