Documentation

Didacticiels

  • Atelier complet sur HealthOmics

    Démarrez avec les flux de travail et le stockage HealthOmics

  • Tutoriels HealthOmics

    Référentiel open source sur GitHub avec exemple de code qui montre comment stocker, traiter et interroger les jeux de données génomiques et biologiques à l’aide d’AWS HealthOmics

Outils

Outils de flux de travail

Workflows de découverte de médicaments

Utilisez cette collection de flux de travail AWS HealthOmics pour accélérer la découverte de médicaments

Exemples de flux de travail

Créez des flux de travail privés basés sur des exemples de flux de travail HealthOmics open source

Exécuter l'analyseur

Run analyzer est un outil d’optimisation des performances d'exécution qui extrait les journaux des manifestes d'exécution depuis CloudWatch et génère des statistiques pour une exécution, y compris l'utilisation du processeur et de la mémoire pour chaque tâche de flux de travail

WDL Linter

Utilisez le linter HealthOmics WDL pour détecter les erreurs de flux de travail courantes avant d’exécuter les flux de travail

Filtre Nextflow

Lint pour les erreurs Nextflow courantes avant l'exécution d'un script de flux de travail

ECR Helper

Migrez les conteneurs existants vers votre référentiel ECR privé à l’aide de l’outil d'assistance ECR

Outil de réexécution

Réexécutez les exécutions archivées à partir des journaux du manifeste d’exécution de CloudWatch

Outils de stockage de données

Lire régler le gestionnaire de transfert

Téléchargez facilement des fichiers à partir d'un ensemble de référence ou de lecture AWS HealthOmics

Importateur axé sur les événements

Application CDK présentant une architecture pilotée par les événements qui automatise l'importation de données dans les magasins de séquences AWS HealthOmics lorsque des objets sont créés dans Amazon S3.

Sequence Store Manifest Generator

Génère un manifeste json pour les tâches d'importation du magasin de séquences AWS HealthOmics

Sequence Store Duplicate Read Set Finder

Identifie les ensembles de lecture dupliqués stockés dans les magasins de séquences AWS HealthOmics

Solutions

Nouveautés

Les flux de travail AWS HealthOmics prennent désormais en charge les GPU NVIDIA L4 et L40S et les options de processeurs étendues
07/03/2025

Annonce de l’accès en lecture à l’entrepôt de données entre comptes pour AWS HealthOmics
22/11/2024

Les flux de travail AWS HealthOmics prennent désormais en charge la mise en cache des appels et l’accès aux fichiers intermédiaires
21/11/2024

AWS HealthOmics prend désormais en charge la détection des versions DSL et Nextflow
13/08/24

AWS HealthOmics prend désormais en charge le stockage dynamique pour les flux de travail privés
30/04/24

AWS HealthOmics prend désormais en charge le partage intercomptes pour les flux de travail privés
30/04/24

AWS HealthOmics annonce la prise en charge de la lecture des magasins de séquences via les API Amazon S3
15/04/24

AWS HealthOmics fournit désormais des informations supplémentaires pour l'exécution des flux de travail
23/02/24

AWS HealthOmics prend désormais en charge le flux de travail DeepVariant Ready2Run d'Ultima Genomics
05/02/24

Le magasin de séquences AWS HealthOmics inclut désormais des ETags calculés automatiquement pour les ensembles de lecture
06/10/23

AWS HealthOmics est désormais disponible dans la région Israël (Tel Aviv)
26/09/23

AWS HealthOmics fournit désormais des fonctionnalités d’archivage et de rétention des séquences de flux de travail
30/08/23

AWS HealthOmics prend désormais en charge la gestion des versions des magasins d’annotations
15/08/23

AWS HealthOmics prend en charge le partage entre comptes de magasins d’analytique Omics
15/08/23

Billets de blog

Stockage des données génomiques et flux de travail améliorés avec MGI, Sentieon et AWS
25/02/2025

Examinez la variation génomique entre les populations avec AWS
29/01/2025

Accélérer la découverte de médicaments grâce à AWS HealthOmics et NVIDIA Blueprints
07/10/2024

Building a secure and low-code bioinformatics workbench on AWS HealthOmics
02/10/2024

Revolutionizing Generative Biology with AWS and EvolutionaryScale
25/06/2024

Comment Takeda Pharmaceuticals accélère la bioinformatique à grande échelle grâce à AWS HealthOmics
19/06/2024

Accédez à de puissantes informations génomiques avec AWS HealthOmics Analytics et Amazon EMR
30/05/2024

Orchestrer plusieurs flux de travail AWS HealthOmics à grande échelle
07/05/24

Démocratisez l’analyse des données omiques avec Basepair sur AWS HealthOmics
29/04/2024

AWS HealthOmics annonce de nouvelles fonctionnalités pour une intégration fluide des magasins de données omiques et des outils d'analyse
17/04/2024

Stockez les données omiques de manière rentable à n’importe quelle échelle avec AWS HealthOmics
24/01/24

Prétraitement des données IRMf sur AWS à l’aide d’AFNI et d’AWS HealthOmics
08/01/24

Nouveaux outils pour accélérer la migration des flux de travail vers AWS HealthOmics
13/12/23

Analyse multimodale des données avec AWS Health et les services de machine learning
16/10/23

Conception d’une architecture pilotée par les événements pour les flux de travail bioinformatiques à l’aide d’AWS HealthOmics et d’Amazon EventBridge
11/10/23

Sécurisez vos flux de travail et vos données génomiques avec AWS HealthOmics
09/10/23

Vidéos


AWS re:Invent 2024 – Élargir les opérations de diagnostic clinique : l’innovation génomique de Natera (48:52)


AWS re:Invent 2024 – Comment Merck améliore la conception de médicaments grâce à des modèles de base biologiques (39:38)


Surmonter les défis scientifiques et informatiques associés à la mise à l’échelle de l’analyse Omics (22:11)


Révolutionner la médecine de précision : Sonrai utilise AWS pour la découverte de médicaments (3:03)


AWS re:Invent 2023 – Innovation en matière d’omics avec AWS HealthOmics : la voie d’Amgen vers des résultats plus rapides


AWS re:Invent 2023 – Création d’une plateforme de médecine de précision à l’aide d’AWS HealthOmics


Atelier AWS HealthOmics de bout en bout : présentation (43:27)


AWS On Air ft. AWS HealthOmics et données ouvertes (20:07)


Utilisation d’AWS HealthOmics pour la génomique de bout en bout (2:03:06)


AWS On Air ft. Flux de travail AWS HealthOmics Ready2Run (26:34)