Recursos de AWS HealthOmics
Documentación
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Guía del usuario
Aprenda a utilizar AWS HealthOmics en esta guía paso a paso para desarrolladores.
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Referencia de la API
Lea esta guía de referencia para las API y los parámetros de AWS HealthOmics.
Herramientas y tutoriales
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Herramientas de código abierto para AWS HealthOmics
Repositorio de código abierto en GitHub con herramientas para trabajar con AWS HealthOmics.
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Tutoriales de código abierto para AWS HealthOmics
Repositorio de código abierto en GitHub con código de ejemplo que muestra cómo almacenar, procesar y consultar conjuntos de datos genómicos y biológicos con AWS HealthOmics.
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Linter de WDL para AWS HealthOmics
Imagen de contenedor alojada en repositorios públicos de Amazon ECR que proporciona líneas generales y recomendaciones específicas para las definiciones de flujos de trabajo de WDL para su uso con AWS HealthOmics.
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Amazon ECR Helper para AWS HealthOmics
Aplicación del CDK de código abierto que automatiza la migración de imágenes de contenedores para su uso con flujos de trabajo de AWS HealthOmics.
Soluciones
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Guidance for Migration & Storage of Sequence Data with AWS HealthOmics
En esta guía, se muestra cómo importar datos de secuencias ómicas de Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) al almacenamiento de AWS HealthOmics.
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Guidance for Multi-Modal Data Analysis with AWS Health and ML Services
En esta guía, se muestra cómo configurar un marco integral para analizar los datos multimodales sanitarios y de ciencias biológicas (HCLS).
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Guía para flujos de trabajo de biocomputación en AWS
En esta guía, se muestra cómo puede crear y ejecutar flujos de trabajo de biocomputación de nivel de producción a escala y utilizar los servicios de AWS para la automatización, el análisis de flujos de trabajo, el almacenamiento y la observabilidad operativa y de costos.
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Guía para el desarrollo de flujos de trabajo bioinformáticos con DevOps en AWS
Esta guía muestra cómo configurar una canalización de integración y entrega continuas (CI/CD) para automatizar el ciclo de vida de sus flujos de trabajo bioinformáticos en AWS HealthOmics.
Novedades
AWS HealthOmics ahora admite la detección de versiones de DSL y Nextflow
13/08/24
AWS HealthOmics ahora admite el almacenamiento de ejecución dinámica para flujos de trabajo privados
30/04/24
AWS HealthOmics ahora admite el uso compartido entre cuentas para flujos de trabajo privados
30/04/24
AWS HealthOmics ahora ofrece información adicional para las ejecuciones de flujos de trabajo
23/02/24
AWS HealthOmics ahora admite el flujo de trabajo Ready2Run de Ultima Genomics DeepVariant
05/02/24
AWS HealthOmics ya está disponible en la región de Israel (Tel Aviv)
26/09/23
AWS HealthOmics ahora ofrece archivo y retención de la ejecución del flujo de trabajo
30/08/23
AWS HealthOmics ahora admite el control de versiones de los almacenes de anotaciones
15/08/23
AWS HealthOmics admite el uso compartido entre cuentas de las tiendas de análisis de datos ómicos
15/08/23
Publicaciones del blog
“Orchestrating Multiple AWS HealthOmics Workflows at Scale”
07/05/24
“Store omics data cost effectively at any scale with AWS HealthOmics”
24/01/24
fMRI Data Preprocessing on AWS using AFNI and AWS HealthOmics
08/01/24
New Tools to Accelerate Workflow Migrations to AWS HealthOmics
13/12/23
Multimodal Data Analysis with AWS Health and Machine Learning Services
16/10/23
Secure Your Genomic Workflows and Data with AWS HealthOmics
09/10/23
AWS HealthOmics now supports Sentieon genomic analysis pipelines
15/05/23
Element Biosciences offers Bases2FASTQ as a Ready2Run workflow on AWS HealthOmics
15/05/23
Easily run NVIDIA Parabricks Ready2Run workflows on AWS HealthOmics
15/05/23
Part 2: Automated End-to-End Genomics Data Storage and Analysis using AWS HealthOmics
29/11/22
Part 1: Introducing AWS HealthOmics—from sequence data to insights, securely and at scale
29/11/22
Videos
AWS re:Invent 2023 - Omics innovation with AWS HealthOmics: Amgen’s path to faster results
AWS re:Invent 2023 - Building a precision medicine platform using AWS HealthOmics
AWS HealthOmics End to End Workshop - Presentation (43:27)
AWS On Air ft. AWS HealthOmics & Open Data (20:07)
Using AWS HealthOmics for Genomics End-to-End (2:03:06)
AWS On Air ft. Ready2Run Workflows on AWS HealthOmics (26:34)
A fast walk through AWS HealthOmics (12:47)
Integrate and derive insights from multi-modal health data (44:37)
Transform omics data into insights with AWS HealthOmics (38:56)